网吧的治理问题已成为互联网整治中久治不愈的顽固疾病。黑网吧等种种问题造成未成年人整日沉迷网络而逃学、辍学、离家出走，甚至导致未成年涉网犯罪的案件不断增加。这些已遭到社会各界人士的不满和投诉，家长和学校的呼吁声非常之高。
一、网吧管理政策不明确
这些年来对网吧的性质和管理方式一直不够稳定和明确。分不清是属于信息服务场所还是文化娱乐场所；对于网吧的治理不知是限制还是规范其发展；对于农村的网吧问题是不知是加强管理还是停止发展。虽然近年来监管部门曾多次整治和整顿网吧问题，但过后还是出现发展失控的问题。
二、管理范围大、力量薄弱不到位
国家政府部门规定文化部门负责网吧的设立审批，工商管理部门负责对黑网吧的查除和取缔，电信部门管接入服务。这些监管部门各管一段，力量不足比较分散，特别是对于一些偏僻的乡镇和农村网吧的监管不够到位。种种问题导致互联网整治网吧的难度加大。
三、网络游戏吸引未成年上网的事件屡禁不止
网络游戏的刺激性吸引着未成年网民群体，继而形成了网吧的利益来源和顾客来源。经济利益的诱惑促使许多网吧主动接纳，甚至引诱未成年人上网。
四、网吧之间的利益竞争
目前，随着互联网的快速普及，家庭上网的费用越来越低，很多人开始选择在家上网。国内网吧的数量巨大，导致他们进入了高投资低利润的营业状态。为了行业间的竞争和提高经营利润，主动违规接纳未成年人。
五、黑网吧顶风营业的状况屡禁不止
开办一家网吧必须有一定的指标和规模，投入资金也相当高，导致申办合法网吧难度增大。监管部门对于黑网吧的整治和查除主要是以没收计算机为主，对经营者不予处理。以黑网吧不用交税、不办理营业执照的特点几个月就能收回成本。只靠没收设备难以起到禁止作用，继而导致一些黑网吧屡禁不止的状况。
六、家长及学校的教育和引导不到位
有些家长对于孩子进网吧的行为只是一味的制止，严厉的批评和处罚，并不注重合理的引导和教育。学校发现学生进网吧也只是采取批评或报告给家长等处理方法。盲目的制止行为使孩子心理受到伤害，继而产生逆反心理。未成年人利用网络游戏、聊天发泄情绪和生活、学习压力的状况日益严重。网络游戏的刺激日益吸引、侵害着未成年人的身心健康。网吧的整顿和管理已成为中国互联网整治中极为重视的问题。